इस निदेशालय का सतर्कता सेटअप मुख्य रूप से डिटेक्टिव और प्रिवेंटिव विजिलेंस से संबंधित है और सक्रिय रूप से विभिन्न प्रकार की शिकायतों से निपटने और प्रसंस्करण में शामिल है, जिसमें इंक्वायरी, औचक निरीक्षण, कर्मियों की सतर्कता मंजूरी, विदेश में पदोन्नति, पदोन्नति और कार्यवाही के कारण, लेक्चर आयोजित करना शामिल है। सतर्कता मामले और सभी लैब्स / एस्टेब्लिशमेंट में वार्षिक सतर्कता जागरूकता सप्ताह। यह सतर्कता से संबंधित मामलों पर रक्षा मंत्रालय / सतर्कता के साथ प्रभावी संपर्क बनाए रखता है। इस निदेशालय का सुरक्षा सेटअप डीआरडीओ लैब्स / एस्टेब्लिशमेंट पर जाने वाले विदेशी नागरिकों के लिए सुरक्षा क्लीयरेंस से संबंधित है, लैब्स / एस्टेब्लिशमेंट की सुरक्षा ऑडिट करता है, आईबी द्वारा लैब / एस्टेब्लिशमेंट का निरीक्षण करता है, डीआरडीओ और डीआरडीओ के बीच एक इंटरफेस के रूप में कार्य करता है। सुरक्षा संबंधी सभी मामलों पर अन्य सुरक्षा एजेंसियां। यह डीआरडीओ लैब्स / एस्टेब्लिशमेंट में सुरक्षा / अप्रिय घटना के किसी भी उल्लंघन की जांच करता है और सुरक्षा कर्मियों के प्रशिक्षण का आयोजन करता है, लैब्स के बाहर संवेदनशील दुकानों के संचालन के दौरान सुरक्षा पहलुओं का समन्वय करता है और सुरक्षा मामलों पर रक्षा मंत्रालय के साथ संपर्क करता है।
राष्ट्रीय औद्योगिक सुरक्षा अकादमी (NISA) हैदराबाद औद्योगिक सुरक्षा पर प्रशिक्षण में विशेषज्ञता वाला देश का एक प्रमुख संस्थान है। NISA द्वारा शुरू किए गए प्रशिक्षण के लाभों का लाभ उठाने के लिए, DRDO के सुरक्षा अधिकारियों के लिए इंस्टॉलेशन सिक्योरिटी पर एक सप्ताह की अवधि का एक कैप्सूल कोर्स नियमित रूप से NISA, हैदराबाद में आयोजित किया जाता है।
सतर्कता के विभिन्न पहलुओं पर सतर्कता कार्यशाला हर साल आयोजित की जाती है। आईबी के साथ समन्वय में सुरक्षा संवेदीकरण कार्यक्रम नियमित अंतराल पर आयोजित किया जाता है।